Protein-Interaktionen und Bahnen

Automatisierte Abfragung und Gültigkeitserklärung der Interaktion durch Co-Entwicklung (RAT) nimmt eine Liste der Proteinreihenfolgen oder der Reihenfolgenpaare als Input und verwendet orthologous Reihenfolgen, um die Ähnlichkeit in der Evolutionsgeschichte der Proteine festzusetzen. Es ist vorgeschlagenes t - [gelesen mehr RAT]

Stellt einige Hilfsmittel einschließlich WIT2, EMP, MPW, SENTRA und PatScan zur Verfügung; andere Hilfsmittel sind auch vorhanden. - [Gelesen mehr Argonne nationalem Laboratorium - Computerbiologie-Datenbanken]

ArrayXPath ist ein web-basiert Service für abgleichende Microarray Genausdruck Profile mit bekannten biologischen Bahnen. Input ist ein gebündeltes Genausdruck Profil in einem Tabulator-abgegrenzten Textformat. Ausgabe umfaßt Bahndiagramme. - [Gelesen mehr ArrayXPath]

Volle Beschreibungen der Speicher von Interaktionen, von molekularen Komplexen und von Bahnen; Forscher sind in der Lage, neue Rekorde einzugeben. - [Mehr gelesen BINDUNG - die biomolekulare Interaktions-Netz-Datenbank]

schließt ein: TRANSFAC - Übertragungfaktordatenbank; Patho DB - veränderte Formulare der Übertragungfaktoren und der verbindlichen Sites, die pathologisch relevant sind; S/MARt DB - Gestellmatrix-Verhandlungdatenbank; TRANSPATH - regelnde Bahndatenbank des Gens. - [Gelesen mehr vorgeschriebenen Datenbanken des BIOBASE Gens]

Informationen über Genfunktion, proteomic Bahnen und Reagensaustausch; sehr freie Bahndiagramme; kann nach Bahnen durch Namen suchen oder eine organisierte Liste durchstöbern. - [Gelesen mehr BioCarta]

BioCyc ist eine Ansammlung Bahn-/Genomdatenbanken berechnete entweder von der Literatur (EcoCyc und MetaCyc) oder rechnerisch (IE. HumanCyc). EcoCyc wird verwendet, um Genplan, biochemische Reaktionen und Bahnen für das Escherichia- Colichromosom sichtbar zu machen; MetaCy - [gelesen mehr BioCyc Wissens-Bibliothek]

Informationen über Reaktion und Besonderheit, Pfosten-Übersetzungsänderungen, Struktur, Stabilität und Referenzen auf anderen Datenbanken; geben Sie für Akademiker frei. - [Gelesen mehr BRENDA - dem kompletten Enzym-Informationssystem]

CNplot ist ein Netzsichtbarmachunghilfsmittel, das für großräumige Netze benutzt werden kann, solange sie vor-gebündelt werden. - [Gelesen mehr CNplot: Sichtbarmachung der Vor-Gebündelten Netze]

Cytoscape ist eine Sichtbarmachungplattform für Gebrauch mit molekularen Interaktionsnetzen. Interaktionsdaten können mit anderen Zustanddaten wie Genausdruckprofilen integriert werden. Der Input zu Cytoscape umfaßt Listen der Interaktionspaare und Tabulator/Platz delimi - [gelesen mehr Cytoscape]

Die Datenbank der zusammenwirkenden Proteine (BAD) erlaubt Benutzern, nach zusammenwirkenden Proteinen zu suchen. Resultatslisten können gesucht werden und/oder sichtbar gemacht werden (statisch oder dynamisch). Benutzer können neue Proteinprotein Interaktionen und Aktualisierungsvorgangsdatenbank- Einträge eingeben. - [Mehr gelesen BAD]

Behälter der Enzymbezeichnungsinformationen; nützliche Auswahl von Kreuzverweisen zu anderen Datenbanken; geben Sie nur zu den Forschungszwecken frei. - [Gelesen mehr ENZYM - Enzymbezeichnungsdatenbank]

Integriertes System für Datenanalyse mit Informationen über Ausdruck- und Gennetze, enthält auch transcriptional regelnde Regiondatenbank (TRRD). - [Gelesen mehr GeneExpress2.1]

iHOP (Informationen Hyperlinked über Proteinen) ist ein System, das ein durch ein Netz der Gene und der Proteine steuern lässt, die auf dem Inhalt der PubMed Auszüge basieren. Für jede Genrecherche berichtet iHOP über Programmsätze von den Auszügen, die sie mit anderem g verbinden - [gelesen mehr iHOP]

Das Ziel von IntEnz ist, eine einzelne relationale Datenbasis zu erstellen, die Enzymdaten von drei verschiedenen Quellen enthält: die offizielle Version der Enzym-Bezeichnung, die Empfehlungen vom Bezeichnungs-Ausschuss des internationalen Anschlußes von Bioch enthält - [gelesen mehr IntEnz: Integrierte relationale Enzymdatenbank]

Datenbank von Protein orthologs, die (interologs) und Proteine auf konservierte regelnde Verhältnisse über Sorten (regulogs) einwirken. Enthält Daten für C.-elegans, Taufliege, Arabidopsis und Hefe. - [Gelesen mehr Interolog/Regulog Datenbank]

InterWeaver ist ein Hilfsmittel, das zwei Ansätze einsetzt, um mögliche Proteininteraktionen zu entdecken, indem er nach sucht und die Beweise deutet, die von den Onlinedatenbanken vorliegend sind. Die erste Annäherung findet Homologe für eine Reihenfolge und sucht nach zusammenwirkenden Partnern - [gelesen mehr InterWeaver]

Bahnkarten, molekulare Kataloge, Genomkarten und Genkataloge, die Wissen über Interaktionen in Informationsbahnen ausgedrückt erfassen. KEGG enthält einige Datenbanken, einschließlich BRITE (Proteinprotein Interaktionen), BAHN (Interaktionsnetze für - [gelesen mehr KEGG: Kyoto-Enzyklopädie der Gene und der Genome]

Curated Datenbank mit einem Fokus auf den experimentell überprüften molekularen Interaktionsdaten gesammelt von der wissenschaftlichen Literatur. Hauptgewicht auf Säugetier- Organismen. - [Gelesen mehr MINZE - einer molekularen Interaktionsdatenbank]

München-Informationszentrale für Protein-Reihenfolgenprojekte umfassen: pilzartige Genomanalyse, Betriebsgenombioinformatik, strukturelle Genomics-, proteomics- und Genomanmerkung. Projekte und Datenbanken umfassen: CYGD, MNCDB, NGFN, MPPI, SIMAP, QUIPOS, MATDB, M - [gelesen mehr MIPSS]

PathBLAST ist ein Hilfsmittel für cross-species Vergleich der Proteininteraktionsnetze. PathBLAST nimmt einen kurzen Proteininteraktionspfad als Input und sucht gegen ein vorhandenes Proteinprotein interation Netz, das vom Benutzer spezifiziert wird. - [Gelesen mehr PathBLAST]

Gebrauch-Path-Analyse des Bahn-Jäger-Hilfsmittels (PHT), zum der biochemischen Bahnen wieder aufzubauen und sichtbar zu machen. Der Benutzer kann das Shortest-Path zwischen zwei Stoffwechselprodukten finden, oder finden Sie alle erreichbaren Produkte oder educts für ein gegebenes Stoffwechselprodukt. - [Gelesen mehr Bahn-Jäger-Hilfsmittel]

Bahn-Bergmann ist ein Hilfsmittel für das Suchen der Listen der Gene nach Verbindungen in bekannten Bahndaten von KEGG, von BioCarta und von GenMAPP. Stellt auch statistische Analysen zur Verfügung. - [Gelesen mehr Bahn-Bergmann]

Die Bahn-Hilfsmittel-Liste (PRL) ist eine Datenbank der Links 150+ zu den Betriebsmitteln für Proteinprotein Interaktionen, metabolisch und signalisierend Bahnen, Übertragungfaktor und genetische Interaktionsnetze, Bahndiagramme, Proteinreihenfolgen und Protein-Verbund - [gelesen mehr Bahn-Hilfsmittel-Liste]

Reactome ist eine Datenbank der menschlichen biologischen Bahnen und der Prozesse, die von den grundlegenden Prozessen des Metabolismus bis zu komplizierten regelnden Bahnen reichen. Die Daten curated von den Biologen und peer-reviewed nachher für Genauigkeit und Übereinstimmung. Kreuzverweise w - [gelesen mehr Reactome - eine Informationsbank der biologischen Prozesse]

Die Beschränkungs-Enzym-Datenbank, eine Nachrichtenbeschaffung über Beschränkungsenzyme und in Verbindung stehende Proteine. - [Gelesen mehr BASIEREN Sie] um

ZEICHENKETTE (Recherche-Hilfsmittel für die Wiederherstellung der zusammenwirkenden Gene/der Proteine) ist eine Proteinprotein Interaktions-/Verbindungsdatenbank. sind bekannte und vorausgesagte Interaktionen enthalten. Die Interaktionen werden von vorhandenen Datenquellen und Literatur und Franc berechnet - [gelesen mehr ZEICHENKETTE]

Taverna ist ein Hilfsmittel für das Erstellen und den Betrieb von Bioinformatikarbeitsflüssen. - [Gelesen mehr Taverna]

Datenbank der genetischen und körperlichen Interaktionen; enthält Interaktionsdaten von einigen Genom/proteome breit-studiert, die MIPS-Datenbank und BINDUNG; stellt ein leistungsfähiges Sichtbarmachungsystem für Interaktionen grafisch betrachten zur Verfügung. - [Gelesenes mehr das RASTERFELD - allgemeiner Behälter für Interaktions-Datensätze]

Anwendung für die körperlichen und genetischen biologischen Interaktionen grafisch darstellen; wird mit dem allgemeinen Behälter der Interaktions-Datensätze verbunden (das RASTERFELD); vorhanden für Unix und Windows. - [Gelesenes mehr das Osprey-Netz-Sichtbarmachung-System]