Microarray Bioinformatic Hilfsmittel

Die Reihen-Klon-Informations-Datenbank (SÄURE) ist ein auffindbares Hilfsmittel zu Information über Menschen, Maus und Ratte cDNA Klone. Jeder Klon enthält Informationen über die zugewiesenen UniGene Blöcke, Standort in der in voller Länge Abschrift, Genontario zugewiesen - [gelesen mehr SÄURE]

Erlaubt Wechselbeziehung der GeneChip Reihenresultate mit Reihenentwurf und Anmerkungsinformationen; bietet Zugang zu den Reiheninhaltsinformationen, einschließlich Prüfspitzenreihenfolgen und Genanmerkungen; freie Registrierung wird benötigt. - [Gelesen mehr Affymetrix NetAffx Analysen-Mitte]

Allgemeiner Behälter für Microarray gründete Genausdruckdaten; enthält einige curated Genausdruckdatensätze. - [Gelesen mehr ArrayExpress]

ArrayPipe erlaubt Benutzern, eine verarbeitenrohrleitung für die Analyse von Microarraydaten anzupassen. Schließt Methoden für Qualitätseinschätzung der Plättchen, der Datensichtbarmachung, der Normalisierung und der Abfragung der differenzial ausgedrückten Gene ein. Ausgabe besteht aus repor - [gelesen mehr ArrayPipe]

ArrayProspector ist ein Set vorausgesagte Funktionsverbindungen zwischen Genen, die von den Microarrayausdruckdaten von der Standford Microarray-Datenbank geschlossen worden sind. Benutzer können suchen nach den Genen, die gebunden werden, um abzufragen oder nach Links zwischen zwei Genen. - [Gelesen mehr ArrayProspector]

ArrayXPath ist ein web-basiert Service für abgleichende Microarray Genausdruck Profile mit bekannten biologischen Bahnen. Input ist ein gebündeltes Genausdruck Profil in einem Tabulator-abgegrenzten Textformat. Ausgabe umfaßt Bahndiagramme. - [Gelesen mehr ArrayXPath]

Bayesische Analyse der Gen-Ausdruck-Stufen (BAGEL). Diese Software ist für zahlreiche vorstehende Studien benutzt worden, einschließlich zwei veröffentlicht in der Wissenschaft, und zwei veröffentlicht in PNAS. Jeffrey Townsend. - [Gelesene bayesischere Analyse der Gen-Ausdruck-Stufen (BAGEL)]

Verarbeiten Sie Extraktion stapelweise und Analyse der diesseits-Regelnden Regionen (BEARR) nimmt eine Liste der Genkennungen (wie RefSeq und Unigene IDs), der Übereinstimmungsmuster und (beliebig) der Positionsgewichtmatrix als Input und Rückkehr eine Liste der Abgleichungen für die Muster im Bot - [gelesen mehr BEARR]

Bioconductor ist eine offene Quelle und geöffnetes ein Programmentwicklungssoftwareprojekt, das darauf abzielt, Zugang zu einer großen Auswahl der leistungsfähigen statistischen und grafischen Methoden für die Analyse von genomic Daten zu bieten. - [Gelesen mehr Bioconductor]

Server, der stromaufwärts von Genen im gleichen Genausdruckblock auf regelnde Reihenfolgenmotive unter Verwendung einer Gibbs Probenahmestrategie scannt. Das Markov Hintergrundmodell wird für Nichtmotiv Unterseiten benutzt und verbessert Besonderheit der vorausgesagten Motivstandorte. - [Gelesen mehr BioProspector]

Das MGuide (Version 2.0). Die brown-Labors schließen Anleitung zum Microarraying für den molekularen Biologen ab. - [Mehr gelesen Bau Ihr eigenes arrayer]

Kontaktinformationen, -verwendbarkeit und -sachkenntnis der kanadischen Microarraymitten; enthält Labors, die cDNA oder Oligonucleotide beschmutzte Reihen und andere Dienstleistungen erbringen, und Labors, die analysieren können, RNS mit Affymetrix bricht ab. - [Gelesene kanadischere Microarray-Betriebsmittel]

Server, der Microarray und Fördererreihenfolgendaten analysiert, verband mit einer Antwort zu einem spezifischen Auslöseimpuls. Nach Analyse wird ein mögliches transcriptional regelndes Netz erstellt. CARRIE stellt auch fest, welche Übertragungfaktoren wahrscheinliches invol waren - [gelesen mehr CARRIE]

Die Mitte für Informations-Biologiegen Ausdruckdatenbank (CIBEX) ist ein allgemeiner Behälter für experimentelle Daten des Genausdrucks. Das Datenbasissystem ist mit dem MIAME Standard gefällig. - [Gelesen mehr CIBEX]

Server, der versucht, alle mögliche Motive zu identifizierenen, stand auf den Genen in Verbindung, die zu den regelnden Elementen des Anteiles vorausgesagt wurden. Er ändert Gibbs Probenahme durch das Beeinflussen von Recherchen in Richtung zu konservierten Reihenfolgen über mehrfachen Sorten. - [Gelesen mehr CompareProspector]

Der konservierte Übertragung-Faktor-verbindliche Site-Sucher (CONFAC) nimmt eine Liste der menschlichen Gennamen und -kennungen als Input und vergleicht sie mit ihren Mausorthologues, um konservierte verbindliche Sites des Übertragungfaktors zu identifizierenen. Weitere Information von t - [gelesen mehr CONFAC]

Diese Web site enthält Microarrayanalysensoftware (Argus und Z-Pool), eine Endothelial Zellen-Ausdruck-Datenbank und andere Betriebsmittel, die auf GefäßEndotheliumforschung in Verbindung gestanden werden. Sehen Sie die PubMed Auszüge zu mehr Information. - [Gelesen mehr definierenden Transcriptional Programmen im GefäßEndothelium]

Doelan ist ein Hilfsmittel, das konzipiert ist, um die Qualität der DNAmicroarrayproduktion zu überwachen. - [Gelesen mehr Doelan]

Ausdruck-Auswerteprogramm ist eine Web gegründete Plattform für die MicroarrayDatenanalyse, die am EBI entwickelt wird. Dieses Hilfsmittel wird mit der ArrayExpress Datenbank, ein allgemeiner Behälter für Microarraydaten integriert. - [Gelesen mehr Ausdruck-Auswerteprogramm]

Der Gen-Ausdruck-Daten-Analysator (GEDA) ist ein Hilfsmittel für die Entdeckung des differenzialen Genausdrucks in einer Teilmenge Patienten. Er wird zu Krebs-in Verbindung stehenden Microarraystudien hergestellt und umfangreiche Optionen für Sichtbarmachung, Klassifikation und Normalisierung anbietet. - [Gelesen mehr Gen-Ausdruck-Daten-Analysator]

GenMAPP (Genmicroarray-Bahn-Auswerteprogramm) ist ein Microarrayausdruckdaten-Sichtbarmachunghilfsmittel und erlaubt, dass Daten auf den Karten angesehen werden, die Gengruppierungen und biologische Bahnen darstellen. - [Gelesen mehr GenMAPP]

Genausdruck- und -hybridationreihendatenbehälter; Onlinehilfsmittel für Wiederherstellung von Genausdruckdaten von irgendeinem Organismus oder von künstlichen Quelle. - [Gelesen mehr GEO - Gen-AusdruckOmnibus]

Die Gen-Ausdruck-Muster-Analysen-Suite (GEPAS) ist eine Ansammlung Hilfsmittel für die Analyse von Microarraydaten einschließlich Datenaufbereitung und bündelt, Beispielvergleich, der Datenbergbau, der an gegründet wird, GEHEN Ausdrücke (FatiGO) und annnotation. Auch geschlossen Hilfsmittel ein - [gelesen worden mehr GEPAS]

Genom-integrierter funktionellentdecker (GFINDer) nimmt eine Liste von Gen/Klon IDs mit Klassifikationinformationen als Input und erlaubt dem Benutzer, die verschiedenen Genkategorien in der Liste unter Verwendung der Anmerkungen der verschiedenen Typen von einigen unterschiedlichen zu kennzeichnen - [gelesen mehr GFINDer]

Gen-Ontology automatisiertes Lexikon (ZIEL) ist ein Hilfsmittel für die Funktionsanalyse von Daten vom SALBEI und von den Microarrayexperimenten. GenOntologyausdrücke werden als die Basis für statistische Analyse verwendet. - [Gelesen mehr ZIEL]

GoMiner organisiert und erlaubt die Sichtbarmachung der großen Sets Gene, die auf GenOntologyklassifikationen basieren. - [Gelesen mehr GoMiner]

GoSurfer ist ein Hilfsmittel für die Sichtbarmachung und das Vergleichen der Gensets, indem er sie auf Informationen des GenOntology (GEHEN Sie), in Form eines hierarchischen Baums abbildet. Es ist für die Untersuchung der Resultate der Microarrayanalysen oder der Genom-breiten Übertragen auf Lochkarten nützlich. - [Gelesen mehr GoSurfer]

Software für MicroarrayBildanalyse. - [Gelesen mehr GridGrinder]

KARMA (Keck Reihen-Manager und Kommentator) erlaubt Sie vergleichen und kommentieren Ihre eigenen Microarrays gegen andere vorhandene Reihen. Vergleich von Reihen kann innerhalb der gleichen Sorte sowie über Sorte erzielt werden (Reihenvergleich basiert auf UniGene Clu - [gelesen mehr KARMA]

MatchMiner ist ein Hilfsmittel, zum der Genkennungen zu vergleichen und zu konvertieren. Benutzer können einzelnes oder Listen der Kennungen von einem Formular zu anderen übersetzen, oder vergleichen Sie zwei Listen der Kennungen als geläufige Genreferenzen. - [Gelesen mehr MatchMiner]