Gen-Regelung

GIPFEL (hoch entwickelte zufriedene abgleichende Maschine für Reihenfolgen) ist ein Server, der benutzt werden kann, um Wiederholungen (zwischen 3 und 10 000 Unterseiten) über mehrfacher Sorte kurz zu suchen. Benutzer können Resultate einer Recherche durch Schlüsselwortrecherchen begrenzen. - [Gelesen mehr GIPFELN]

Verarbeiten Sie Extraktion stapelweise und Analyse der diesseits-Regelnden Regionen (BEARR) nimmt eine Liste der Genkennungen (wie RefSeq und Unigene IDs), der Übereinstimmungsmuster und (beliebig) der Positionsgewichtmatrix als Input und Rückkehr eine Liste der Abgleichungen für die Muster im Bot - [gelesen mehr BEARR]

Server, der stromaufwärts von Genen im gleichen Genausdruckblock auf regelnde Reihenfolgenmotive unter Verwendung einer Gibbs Probenahmestrategie scannt. Das Markov Hintergrundmodell wird für Nichtmotiv Unterseiten benutzt und verbessert Besonderheit der vorausgesagten Motivstandorte. - [Gelesen mehr BioProspector]

Server, der den Microarray und Fördererreihenfolgendaten analysiert, die mit einer Antwort zu einem spezifischen Auslöseimpuls verbunden sind. Nach Analyse wird ein mögliches transcriptional regelndes Netz erstellt. CARRIE stellt auch fest, welche Übertragungfaktoren wahrscheinliches invol waren - [gelesen mehr CARRIE]

Server, der versucht, alle mögliche Motive zu identifizierenen, stand auf den Genen in Verbindung, die zu den regelnden Elementen des Anteiles vorausgesagt wurden. Er ändert Gibbs Probenahme durch das Beeinflussen von Recherchen in Richtung zu konservierten Reihenfolgen über mehrfachen Sorten. - [Gelesen mehr CompareProspector]

Der konservierte Übertragung-Faktor-verbindliche Site-Sucher (CONFAC) nimmt eine Liste der menschlichen Gennamen und -kennungen als Input und vergleicht sie mit ihren Mausorthologues, um konservierte verbindliche Sites des Übertragungfaktors zu identifizierenen. Weitere Information von t - [gelesen mehr CONFAC]

Entdecken Sie verbindliche Sites des Übertragungfaktors in den genomic Reihenfolgen unter Verwendung des phylogenetischen Footprinting und der experimentell-bestätigten verbindlichen Profile. - [Gelesen mehr Consite]

CREME (Diesseits-Regelnder Modul-Forscher für das menschliche Genom) ist ein Hilfsmittel für die Bestimmung und die Sichtbarmachung der diesseits-regelnden Module für ein gegebenes Set Gene, die möglicherweise Co-ausgedrückt oder Co-geregelt werden. Sie nimmt als Input eine Liste der Akzessionsnummern und Re - [gelesen mehr CREME]

Diese Web site enthält Microarrayanalysensoftware (Argus und Z-Pool), eine Endothelial Zellen-Ausdruck-Datenbank und andere Betriebsmittel, die auf GefäßEndotheliumforschung in Verbindung gestanden werden. Sehen Sie die PubMed Auszüge zu mehr Information. - [Gelesen mehr definierenden Transcriptional Programmen im GefäßEndothelium]

Bearbeiten Sie, das im Entwurf und in der Qualitätskontrolle von kleinem behindernRNAs (siRNAs) für RNS-Störung (RNAi) und das Genzum schweigen bringen hilft. Es wertet die hemmende Kraft der möglichen siRNA Reihenfolgen sowie die Bestimmung der Genregionen aus, die ein hohes sil haben - [gelesen mehr DEQOR]

Datenbank der verbindlichen Sites des Übertragungfaktors hergestellt vom systematischen Literatur curation und von der Genomanmerkung der Abdrücke der DNAse I für Taufliege. - [Gelesen mehr Abdruckdatenbank der Taufliege-DNAse I]

Eponine ist eine Wahrscheinlichkeitsmethode für das Entdecken der Übertragunganfangssites (TSS) in der Säugetier- genomic Reihenfolge, mit guter Besonderheit und ausgezeichneter Positionsgenauigkeit. - [Gelesen mehr Eponine]

Erster Exon-Sucher (FirstEF) ist ' Terminalvorhersageprogramm des exon 5 und des Förderers. Er besteht aus den verschiedenen diskriminierenden Funktionen, die als Entscheidungsbaum strukturiert werden. - [Gelesen mehr FirstEF]

Greifen Sie zu den Datenbanken, zu Programmen und zu Papieren zurück, die auf Genregelung in Verbindung gestanden werden. - [Gelesen mehr Gen-Regelung]

Umfangreicher Server, der eine große Auswahl der Hilfsmittel für Musterentdeckung in den DNA-und Proteinreihenfolgen sowie in Text besitzt. Hilfsmittel für mehrfache Reihenfolgenausrichtung, Genentdeckung, Proteinanmerkung und andere Anwendungen existieren auch von diesem Server. Ein Detail - [gelesen mehr IBM-Bioinformatik-und Muster-Entdeckung-Gruppe]

JASPAR ist eine non-redundant, curated Ansammlung verbindliche Profile des Übertragungfaktors. Jedes Profil wird von erschienenen, experimentell definierten verbindlichen Sites des eukaryotic Übertragungfaktors festgelegt. - [Gelesen mehr JASPAR]

Recherche nach verbindlichen Sites des möglichen Übertragungfaktors in Ihren eigenen Reihenfolgen unter Verwendung der TRANSFAC Matrizen; geben Sie für nicht gewerblichen Gebrauch frei. - [Gelesen mehr MatInspector]

Server konzipierte, der Interaktion ProteinDNA an den niedrigen waagerecht ausgerichteten Paaren festzulegen Sites. Gebrauch Chip-kleidet die Daten, Wortaufzählung und Position-spezifische Gewichtmatrix, die ändert, um nach den Motiven zu suchen, die diese Interaktionssites darstellen. - [Gelesen mehr MDscan]

MSCAN nimmt, während Input eine oder mehrere DNA-Reihenfolgen und ein Set Übertragung Faktor bei Profilen der verbindlichen Sites darstellen. Es entdeckt dann Blöcke der verbindlichen Sites in den Reihenfolgen. - [Gelesen mehr MSCAN]

Die Web site der Staat Ohio-Hochschulmenschlichen Krebs-Genetik-Bioinformatikgruppe. Diese Site hat viele Betriebsmittel, einschließlich Datenbanken der Förderer und der Übertragungfaktoren, Software-Tools, um verbindliche Sites der möglichen Übereinstimmung vorauszusagen P53 und vorauszusagen - [gelesen mehr OSU Bioinformatik und Computerbiologie]

Ein Server für die Abfragung, Vergleich und Überprüfung der Übertragung stellen Faktor bei Motiven der verbindlichen Sites in den Förderern dar. Die POBO Urladenanalyse, die an ein oder zwei Blöcken der Co-geregelten Gene angewendet wird, entdeckt Motive unter extremen Niveaus der Darstellung. - [Gelesen mehr POBO]

Vergleicht zwei DNA-Reihenfolgen, zulassend Umstellungen und Versetzungen, ideal für Förderer. - [Gelesen mehr PromoterWise]

Datenbank der Proteinfamilien und -gebiete definiert von der SwissProt Datenbank; erwägen Sie, spezifische Motivdatenbanken wie PhosphoBase auch zu überprüfen. - [Gelesen mehr PROSITE]

Auffindbares Literaturnetz der menschlichen Gene mit Hilfsmitteln für Genausdruckanalyse. Wählen Sie vom freien öffentlichen Dienst, oder kaufen Sie das Handelspaket. - [Gelesen mehr PubGene]

RNS-Motiv-Rechercheprogramm, das RNS-Motive identifizierent, benannte riboswitches, die metabolische verbindliche Gebiete in mRNA sind, die Genausdruck regeln. Das Programm war ursprünglich um ein Set riboswitches konzipiert, die im Bacillus-subtilis gefunden wurden. - [Gelesen mehr Riboswitch Sucher]

RiceTFDB (Reis-Übertragung-Faktor-Datenbank) ist eine Datenbank von Reihenfolgen und von Ausrichtungen für Übertragungfaktoren im Reis. - [Gelesen mehr RiceTFDB]

Server, der verbindliche Sites des Übertragungfaktors (TFBS) durch die Kombination von TFBS Vorhersage, Reihenfolgenvergleich und Blockanalyse entdeckt. - [Gelesen mehr rVISTA]

Server mit drei Hilfsmitteln für den rationalen Entwurf von kleinem behindernRNAs (Sirna), von antisense Oligonucleotides (Soligo) und von Transport-Spaltung von ribozymes (Sribo). Ein viertes Hilfsmittel, Srna, bringt Ausgabe einschließlich allgemeine faltende Merkmale zurück. - [Gelesen mehr Sfold]

Server, der den Entwurf von kurzem behindernRNAs (siRNAs) unterstützt durch die Lieferung von Informationen auf Stabilität, SNPs und Besonderheit des möglichen siRNA. - [Gelesen mehr siRNA Auswahl-Server]

Dieses Hilfsmittel umfaßt siSearch, AOSearch und ein siRNAdb, das eine Plattform für das Bergbau einer siRNA Datenbank zur Verfügung stellt, und das Suchen nach unspezifischen Abgleichungen zu Ihrem siRNA (kleines behindernRNAs). - [Gelesen mehr siRNAdb]