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Phylogenese-Rekonstruktion-Bioinformatik-Hilfsmittel und Software online.
| CIPRes - http://www.phylo.org/ Das Cyberinfrastructure, damit phylogenetische Projektziele der Forschung (CIPRes) eine Computerinfrastruktur für Systematik entwickeln. Andere Ziele des Projektes umfassen die Bereitstellung eines zentralen Hilfsmittels, Computersystematik und Ausbildung und traini aktivierend - [gelesen mehr CIPRes] |
| Codon-Verbrauch-Datenbank - http://www.kazusa.or.jp/codon/ Entdeckung GASCHROMATOGRAPHIE-Inhalt und Frequenz des Codonverbrauches für irgendeinen Organismus, der eine Reihenfolge in GenBank hat. - [Gelesen mehr Codon-Verbrauch-Datenbank] |
| Joes Site - Phylogenese-Programme - http://evolution.genetics.washington.edu/phylip/software.html Komplette Liste der Phylogenesepakete, kompiliert von Joe Felsenstein, Schöpfer von Phylip. - [Gelesen mehr Joes Site - Phylogenese-Programmen] |
| GROSS - http://www.megasoftware.net/ (Molekulare Evolutionsgenetik-Analyse) ist ein Anwendungspaket für phylogenetische Analyse mit einer grafischen Benutzerschnittstelle GROSS. Es darf von den ausgerichteten Inputreihenfolgendaten ansehen und bearbeiten und liefert viele Hilfsmittel für die phylogenetischen und statistischen Anekdoten - [gelesene GROSS] |
| Süßhülsenbaum - http://mesquiteproject.org/mesquite/mesquite.html Süßhülsenbaum ist ein Software-Projekt, das konzipiert ist, um vergleichbare Daten über Organismen und Evolutionsanalysen zu beschäftigen. Süßhülsenbaum enthält Module für phylogenetische Analyse, Bevölkerungsgenetik und nicht-phylogenetische multivariate Analyse. - [Gelesen mehr Süßhülsenbaum] |
| NCBI Taxonomie-Datenbank - http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy Taxonomische Klassifikation aller Organismen mit Reihenfolgen in GenBank. - [Gelesen mehr NCBI Taxonomie-Datenbank] |
| NJplot - http://pbil.univ-lyon1.fr/software/njplot.html NJplot ist ein Hilfsmittel für die Sichtbarmachung der binären Bäume wie die phylogenetischen Bäume, die von den PHYLIP Programmen ausgegeben werden. Availiable für einige Plattformen einschließlich Windows, Mac Os, Linux und Solarisen. - [Gelesen mehr NJplot] |
| Orthologue Search Service - http://dove.embl-heidelberg.de/Blast2e/ SPRENGEN Sie, eine Proteinreihenfolge dann führen Sie automatisierte phylogenetische Analyse durch, um orthologous Reihenfolgen zu entdecken. - [Gelesen mehr Orthologue Search Service] |
| PHYLIP - http://evolution.genetics.washington.edu/phylip.html Komplettes Set Programme für phylogenetische Analysen; vorhanden für PC und Mac; Quellencode vorhanden für das einfache Kompilieren in UNIX. - [Gelesen mehr PHYLIP] |
| PhyloBLAST - http://www.pathogenomics.bc.ca/phyloBLAST/ SPRENGEN Sie eine Proteinreihenfolge, dann führen Sie automatisierte phylogenetische Analyse auf Hits oder auf gehochladenen Reihenfolgen durch; PHYLIP-gegründete Analysen. - [Gelesen mehr PhyloBLAST] |
| PHYML - http://atgc.lirmm.fr/phyml/ Phyml ist ein Programm, das phylogenetische Bäume von den Reihenfolgenausrichtungen unter Verwendung der Methode der maximalen Wahrscheinlichkeit konstruiert. - [Gelesen mehr PHYML] |
| Puzzleboot - http://hades.biochem.dal.ca/Rogerlab/Software/software.html#puzzleboot Puzzleboot ist ein UNIX-Shell-Skript, das Urladenanalyse unter Verwendung TREE-PUZZLE und PHYLIP erleichtert. Es erhöht TREE-PUZZLE, indem es ein mehrfache Datensätze analysieren lässt, und kann für Protein- und DNA-Abstandsurladenanalyse verwendet werden. - [Gelesen mehr Puzzleboot] |
| Ribosomales Datenbank-Projekt - http://rdp.cme.msu.edu/ In hohem Grade curated Datenbank der ausgerichteten und angemerkten rRNA Reihenfolgen mit dem Begleiten von Phylogenesen; Daten vorhanden für Download. - [Gelesenes ribosomaleres Datenbank-Projekt] |
| Baum des Lebens - http://phylogeny.arizona.edu/ Multi-geschriebenes Projekt, das versucht, die gesamte Phylogenese des Lebens auf Erde online darzustellen. - [Gelesen mehr Baum des Lebens] |
| TREE-PUZZLE - http://www.tree-puzzle.de/ Baum-Puzzlespiel ist ein Programm, das phylogenetische Bäume von den Reihenfolgenausrichtungen unter Verwendung der Methode der maximalen Wahrscheinlichkeit konstruiert. - [Gelesen mehr TREE-PUZZLE] |
| TreeJuxtaposer - http://olduvai.sourceforge.net/ TreeJuxtaposer ist ein freies Software-Tool, das einen Sichtvergleich von zwei Bäumen im Newick Format erlaubt (Phylogenesen, Taxonomie, Genbäume, etc.). Es kann mit den Bäumen arbeiten, die bis 500.000 Knotenpunkte haben und automatisch berechnet und markiert die Unterschiede. - [Gelesen mehr TreeJuxtaposer] |
| TreeView - http://taxonomy.zoology.gla.ac.uk/rod/treeview.html Legt nette Grafiken der Bäume fest; liest mehrfache Baum-Dateiformate; vorhanden für Download für Mac oder PC. - [Gelesen mehr TreeView] |
| UCMP Phylogenese-Flügel - http://www.ucmp.berkeley.edu/exhibit/phylogeny.html „Phylogenese-Verschiedenartigkeit des Lebens durch Zeit“ ist eine Onlineausstellung an der Universität des Kalifornien-Museums von Paläontologieweb site. Es gibt eine Einleitung zum phylogenetics und zum cladistics, und Sie können durch einen sehr informativen phylogenetischen Baum r steuern - [gelesen mehr UCMP Phylogenese-Flügel] |
| Verstehenentwicklung - http://evolution.berkeley.edu/evosite/evohome.html fantastische Site für unterrichtende/verstehenentwicklung - [gelesen mehr verstehenentwicklung] |
| Weighbor - http://www.t10.lanl.gov/billb/weighbor/index.html Weighbor ist ein Hilfsmittel für das Aufbauen der phylogenetischen Bäume von den Abstandsmatrizen. Es setzt eine belastete Version der Nachbar-verbindenmethode ein, in der längere Abstände in der Matrix weniger Gewicht gegeben werden. - [Gelesen mehr Weighbor] |
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