Bioinformatics, Protocols, DNA RNA Protein Proteomics Bioinformatika, protokoly, DNA, RNA bílkovin Proteomics

Biology Home Protocols Bioinformatic Tools Biology Forums Molecular Biology Encyclopaedia Molecular Biology Images Bookmark Us! Biologie Home protokoly bioinformačních nástrojů biologie Fórum molekulární biologie Encyclopaedia molekulární biologie Obrázky Přidat k oblíbeným!

home > protein > bioinformatics > gettingstarted > index.php home> bílkoviny> bioinformatika> gettingstarted> index.php

Molecular Biology Home Science News Science Videos DNA RNA Protein Proteomics Research BETA! Bioinformatics Lab Equipment Molecular Biology Techniques Molecular Biology Products and Services Related Biology Links Molekulární biologie Domů Věda Sport Věda Video DNA, RNA bílkovin Proteomics výzkum BETA! Bioinformatika Lab Vybavení molekulární biologie Techniky molekulární biologie Produkty a služby související Biologie Odkazy

Molecular Biology Blog Molekulární biologie Blog

Send this page to a friend Pošlete tuto stránku svému příteli

Intracellular Stations Intracelulární stanic

Antibody Botany Common Buffers Buffers Alphabetic Bookstore Cell Biology and Culture Gel Electrophoresis Histology Microarrays Immunology Mass Spectrometry Microbiology Molecular Imaging Peptide Proteomics Protein Microarray Chips PCR Real-Time PCR RNAi and SiRNA Stem Cell Biology Transfection Western Blot Protilátka botaniky společného Vymazat Vymazat Alphabetic Knihkupectví buněčné biologie a kulturu gel Elektroforeza histologie Microarrays imunologie Mass Spectrometry mikrobiologie Molekulární Imaging peptid Proteomics Bílkoviny Microarray Chips PCR, Real-Time PCR a siRNA RNAi Stonek Buňka Biologie transfekce Western Blot

Protein Protocols Bílkoviny protokoly

Protein Encyclopedia Bílkoviny Encyklopedie

Protein Bioinformatics Bílkoviny Bioinformatika

Protein Science Forum Protein Science fórum

Protein Blog Bílkoviny Blog

DNA News DNA Novinky

Protein Bioinformatics Bílkoviny Bioinformatika

Protein regulation, protein localization, protein motifs, protein expression, protein structure, post-translational modifications of protein, protein interactions, and protein function are important because proteins constitute the largest functioning entity inside the cell. Bílkoviny regulace, lokalizace proteinu, motivy proteinů, bílkovin projevu, bílkovinné struktury, post-translační úpravy bílkovin, interakcí bílkovin, bílkoviny a funkce jsou důležité, protože proteiny tvoří největší fungující subjekt uvnitř buněk. Proteomic Bioinformatics is thecollection, organization and analysis of large amounts of proteomic data, using networks of computers and databases. Proteomická Bioinformatika je thecollection, organizaci a analýzu velkého množství proteomic dat pomocí sítí počítačů a databází.

Getting Started with Protein Bioinformatics Začínáme s Bílkoviny Bioinformatika

You must start with your protein sequence. Musíte začít s vaší sekvence proteinu. To obtain the sequence of your protein do the following. K získání sekvence proteinu vaše udělat následující. Visit the following links and search for the protein you are studying. Navštivte následující odkazy a vyhledávání na bílkoviny jste studovat.

Protein sequence databases are categorised as primary, composite or secondary. Sekvence proteinu databáze jsou označit jako primární, kompozitní nebo sekundární. Primary databases contain protein sequences and function as a repository for raw data. Primární databáze obsahují sekvence proteinu a fungovat jako úložiště pro primární údaje.

Search for Proteins and Protein Sequences using: Vyhledávání na bílkoviny a bílkovinné sekvence pomocí:

Protein Primary Amino Acid Sequence Bílkoviny Primární sekvence aminokyselin
Physical or Chemical Properties Fyzikální nebo chemické vlastnosti
Nucleotide Sequences Nukleotidové sekvence
Peptide Sequences Peptidové sekvence
Text Strings Text Struny

Search for Proteins using Protein Primary Amino Acid Sequence Vyhledávání na proteiny pomocí Bílkoviny Primární sekvence aminokyselin

PepSea - Protein identification by searching a sequence PepSea - Bílkoviny identifikační hledáním sekvence

Search for Proteins using Physical or Chemical Properties Vyhledávání na proteiny pomocí fyzikální nebo chemické vlastnosti

MassSearch : - Search SwissProt or EMBL Databases by protein mass after digestion at ETH-Zürich MassSearch: - Vyhledávání SwissProt nebo EMBL databáze o hmotnosti po trávení bílkovin na ETH Zürich -
TagIdent : - Retrieve SwissProt proteins given pI and Mw at ExPASy TagIdent: - načtení SwissProt bílkovin vzhledem k tomu, Pi a mw v ExPASy
AACompIdent -is a tool which allows the identification of a protein from its amino acid composition. AACompIdent-je nástroj, který umožňuje identifikaci proteinu z jeho složení aminokyselin. It searches the Swiss-Prot and / or TrEMBL databases for proteins, whose amino acid compositions are closest to the amino acid composition given. Je hledá Švýcarskou-Prot a / nebo TrEMBL databází na proteiny, aminokyseliny, jejichž skladby jsou nejblíže k aminokyseliny složení uveden.

Search for Proteins by Using Nucleotide Sequences Vyhledávání na proteiny pomocí sekvence nukleotidů

BLAST (BLAST: Basic Local Alignment Research Tool) (NCBI) BLAST (BLAST: Základní Místní Orientace výzkum Tool) (NCBI)
BEAUTY (BLAST Enhanced Alignment Utility) BEAUTY (BLAST Užší Orientace Utility)

Search for Proteins Using Peptide Sequences Vyhledávání na Proteins Using peptidové sekvence

BLAST (BLAST: Basic Local Alignment Research Tool) (NCBI) BLAST (BLAST: Základní Místní Orientace výzkum Tool) (NCBI)
Aldente Identify proteins with peptide mass fingerprinting data. Aldente Identifikace proteinů s peptid hmotnost snímání otisků prstů údajů. A new, fast and powerful tool that takes advantage of Hough transformation for spectra recalibration and outlier exclusion Nový, rychlý a mocný nástroj, který využívá Houghova transformace spektra pro kalibraci a outsider vyloučení
PepSea - Protein identification by peptide mapping or peptide sequencing from Protana, Denmark. PepSea - Bílkoviny identifikace pomocí peptidové mapování a sekvenování peptidů z Protana, Dánsko.
MultiIdent tool - Identify proteins with pI , Mw , amino acid composition, sequence tag and peptide mass fingerprinting data MultiIdent nástroje - Identifikace proteinů s PI, mw, složení aminokyselin, sekvence štítkem a peptid hmotnost snímání otisků prstů údajů

Search for Proteins by Using Text Strings Vyhledávání na proteiny pomocí řetězce

Integr8 Integr8

Entrez-Pubmed Protein Query Entrez-Pubmed Bílkoviny dotazu

Protein sequence - primary sequence of proteins (primary) Sekvence proteinu - primární sekvence proteinů (primární)

SWISS-PROT SWISS-PROT
PIR-International PIR-International
Entrez-Pubmed Protein Query Entrez-Pubmed Bílkoviny dotazu

Protein sequence (secondary) Sekvence proteinu (sekundární)

Secondary databases contain information derived from protein sequences and help the user determine whether a new sequence belongs to a known protein family. Sekundární databáze obsahují informace získané z proteinů sekvencí a pomůže uživateli určit, zda nové sekvence patří do rodiny známých bílkovin.

PROSITE PROSITE
PRINTS GRAFIKA
Pfam Pfam

Protein sequence (composite) Sekvence proteinu (kompozitní)

Composite databases such as OWL and the NRDB compile and filter sequence data from different primary databases to produce combined non-redundant sets that are more complete than the individual databases and also include protein sequence data from the translated coding regions in DNA sequence databases. Kompozitní databází, jako je OWL a NRDB kompilace a sekvence filtr primárních dat z různých databází vyrábět kombinované non-redundantní soubory, které jsou více než kompletní jednotlivých databází a rovněž obsahovat bílkovinné sekvence dat z přeložen kódování regiony v sekvenci DNA databáze.

OWL OWL
NRDB NRDB