Bioinformatics, Protocols, DNA RNA Protein Proteomics Биоинформатика, протоколи, протеини, ДНК, РНК Proteomics

Biology Home Protocols Bioinformatic Tools Biology Forums Molecular Biology Encyclopaedia Molecular Biology Images Bookmark Us! Начало Биология протоколи Bioinformatic инструменти биология форуми молекулярна биология енциклопедия молекулярна биология изображения Bookmark нас!

home > protein > bioinformatics > protein-structure > index.php начало> протеин> биоинформатиката> структура протеин-> index.php

Molecular Biology Home Science News Science Videos DNA RNA Protein Proteomics Research BETA! Bioinformatics Lab Equipment Molecular Biology Techniques Molecular Biology Products and Services Related Biology Links Молекулярна биология Начало Новини науката науката видеоклипове, ДНК, РНК протеин Proteomics изследвания бета! Биоинформатиката Lab оборудване молекулярна биология техники за молекулярна биология продукти и услуги, свързани с биологията Връзки

Molecular Biology Blog Молекулярна биология блог

Send this page to a friend Изпратете страницата на приятел

Intracellular Stations Вътреклетъчна станции

Antibody Botany Common Buffers Buffers Alphabetic Bookstore Cell Biology and Culture Gel Electrophoresis Histology Microarrays Immunology Mass Spectrometry Microbiology Molecular Imaging Peptide Proteomics Protein Microarray Chips PCR Real-Time PCR RNAi and SiRNA Stem Cell Biology Transfection Western Blot Antibody, можете да ги зададете на общата буферите буферите азбучен книжарница клетъчна биология и култура гел-електрофореза хистология Microarrays имунология масова спектрометрия микробиология молекулярна изображения пептид Proteomics протеин Microarray чипове PCR в реално време PCR RNAi и Намесвам стъбло килия биология Transfection Western Blot

Protein Protocols Протеин протоколи

Protein Encyclopedia Протеин енциклопедия

Protein Bioinformatics Протеин Биоинформатика

Protein Science Forum Протеин науката форум

Protein Blog Протеин Blog

DNA News ДНК Новини

Protein Structure Prediction Протеин структура Прогнози

Bioinformatic Tools are able to predict a protein's structure either in 2-dimensions (2-D) or three-dimensions (3-D). Bioinformatic инструменти са в състояние да прогнозираме протеин в структурата на всяка 2-размери (2-D) или три измерения (3-D). This may not be a real representation of the actual structure of a protein, however it is a good starting point to predict enzymatic pockets, and protein-protein interaction domains. Това не може да бъде реално представителство на реалната структура на белтък, обаче, че е добра отправна точка да се предскажат ензимна джобове, както и протеин-протеин взаимодействие домейни. After prediction, confirmation of protein structure can be made using X-ray Crystallography techniques. След като прогнозата, потвърждение на протеин структура може да бъде направено чрез рентгенова кристалография техники.

Bioinformatic Programs Used to Predict Secondary Structure: Bioinformatic програми, използвани за прогнозираме вторична структура:

(Please see our Protein Structure Prediction Bioinformatic Tools Database for 2-D prediction; (Моля, вижте нашите протеини Структура прогнозиране Bioinformatic Инструменти Database за 2-D прогноза;

and Protein Structure Prediction Bioinformatic Tools Database for 3-D prediction. ; and our database for Retrieving Protein Structure Data from 3-Dimensional Databases. и протеинови Структура прогнозиране Bioinformatic Инструменти база данни за 3-D прогноза.; и нашата база данни за извличането на протеини Структура на данните от 3-измерение бази данни.

Experimental data can be used to help in prediction protein structure. Експериментални данни могат да бъдат използвани за помощ при прогноза протеин структура. The following are experiments that can help in protein structure analysis: Следват експерименти, които могат да помогнат в анализа протеин структура:

- Localization of disulphide bonds (provide tight restraints on the location of cysteines in space) -- Откриване на дисулфид облигации (предвиждат строги ограничения върху разположението на cysteines в пространството)

- Spectroscopy data which can give clues to the secondary structure composition of your protein of interest -- Спектроскопия данни, които могат да дадат улики за вторична структура, състав на своя протеин на интереси

- Site directed mutagenesis experiments, (substituting Alanine A Ala for various amino acids and then checking function of the protein) which can give important insight to the residues which are important in the active site of an enzyme or protein-protein interacting binding sites or domains. -- Карта на мутагенеза, насочена експерименти (замяна на аланин А Ала за различните аминокиселини и функция за проверка на протеин), които могат да дадат важен поглед към остатъци, които са важни в активния сайт на ензим или протеин-протеин взаимодействие задължителен сайтове или домейни .

- Obtain experimental data of post-translational modifictions (eg phosphorylation and glycosylation sites can suggest residues that must be externally accessible and thus may be surface residues) -- Получи експериментални данни, на пост-translational modifictions (напр. phosphorylation и glycosylation сайтове може да предложи остатъци, които трябва да бъдат достъпни извън него и по този начин могат да бъдат площ остатъци)

- Proteolytic Cleavage sites. -- Proteolytic Cleavage сайтове.

Keeping this data in mind when conducting prediction of protein structure is important, as this is structural data that has been proved experimentally.0 Водене на тези данни се има предвид при провеждане на прогнозиране на протеин структура е важно, тъй като това е структурни данни, че е било доказано, experimentally.0

Question whether structure predictions agree with experimental results. Въпросът дали структура са реставрирани и са съгласни с експериментални резултати. This can test the validity of the predicted protein structures. Това може да изпробва действието на протеин, прогнозира структури.