home > protein-microarrays > applications-protein-chips > index.php начало> протеин-microarrays> заявления-протеин-чипове> index.php
 |
|---|
 |  |  |  |  |  |
|---|---|---|---|---|---|
Protein Array Protocols Протеин множество протоколи | Protein Array Bioinformatics Протеин масив Биоинформатика | Learn about Protein Arrays Научете повече за протеин масиви | Protein Array Kits and Products Протеин масив комплекти и продукти | Protein Array Forum Протеин масив форум | Proteomic News Proteomic Новини |
Protein and Antibody Microarrays Протеин и антитела Microarrays
Applications of Protein Chips Заявленията на протеини чипове
1) Proteomics 1) Proteomics
Protein chip technologies will provide a powerful, high-throughput and versatile tool for the genome-scale analysis of gene function (see Figure 4). Enzyme activity, protein–protein and protein–nucleic-acid interactions, and small-molecule drug interactions may all be analyzed directly on the protein level (77,78). Arrays may be engineered to address protein identification, quantitation, and affinity studies. A profiling array may quantitate levels of specific proteins on a global scale allowing for a comparison of normal and disease states. An affinity array may analyze the interactions of peptides, proteins, oligonucleotides, sugars, lipids, or small molecules and chemicals with immobilized proteins such as receptors, enzymes, or antibodies (8). Протеин чип технологиите ще дадат по-мощен, с висока производителност и гъвкави инструмент за геном мащаб анализ на генна функция (вж. Фигура 4). Ензим дейност, протеин-протеин и протеин-Нуклеинова киселина-взаимодействия, и малките молекула лекарствени взаимодействия май всички бъдат анализирани директно върху протеин ниво (77,78). ред може да бъде изработен за идентифициране на адрес протеин, quantitation, и афинитет проучвания. масив А междувременно мога quantitate нива на специфични белтъци в глобален мащаб се даде възможност за сравнение на нормалното и болест държави. An афинитет масив май анализира взаимодействието на пептиди, протеини, oligonucleotides, захари, липиди, или малки молекули и химикали с имобилизиран рецептори, като например протеини, ензими, или антитела (8).
Currently, the rate-limiting step is the production of large numbers of proteins. В момента, ставката за ограничаване стъпка е производството на голям брой белтъци. The ability to automate protein production and proteins fused to high-affinity tags will greatly expedite protein-chip development. Възможността да се автоматизира производството протеин, протеини и сплави на високо афинитет тагове значително ще ускори протеин чип развитие. High-density chips containing large sets of proteins or even entire proteomes will allow the high-throughput analysis of biochemical activities, protein–protein interactions and post-translational modifications, such as phosphorylation, dephosphorylation, protein methylation, and ubiquitination. Висока плътност чипове, съдържащи големи множества от протеини или дори цялата proteomes ще позволи на висока производителност анализа на биохимичните дейности, протеин-протеин взаимодействия и след translational модификации, като phosphorylation, dephosphorylation, протеинови methylation и ubiquitination.
The ultimate goal of proteomics is to the study biochemical activities of every protein encoded by an organism or proteome. A landmark study conducted prepared the first proteome chip by cloning ~94% (>5800 of 6200) of the yeast open reading frames in a yeast expression vector which expressed the proteins as N-terminal GST-His x6 double tagged fusions. A high-throughput yeast protein purification method was developed to individually purify proteins. Крайната цел на proteomics е да проучването биохимични дейността на всички протеини, кодирани с един организъм или proteome. Ключов проучване проведено подготвиха първите proteome чип с клониране ~ 94% (> 5800 на 6200) на дрожди отворена четене кадъра в яйце Изразът вектор, които изразиха протеини, както N-терминал GST-Негово x6 двойно маркирани fusions. високо производителност дрожди метод за пречистване на протеини е разработена поотделно за очистване на протеини. 80% of yeast proteins were full length and of sufficient quantity to be detectable by most assay types. 80% от дрожди протеини са пълна дължина и на достатъчно количество, за да се открие чрез изследване на повечето видове. The proteins were then purified using the GST tags and were then attached to Ni-NTA-coated glass slides using the HisX6 tags. In addition to identifying known interactions, 33 novel binding proteins were detected. 150 novel lipid-binding proteins were also identified. This study demonstrated that an entire proteome can be immobilized on a glass surface to directly screen for interactions with proteins and small molecules (26). Протеините са били тогава пречистена чрез GST тагове и след това са били прикрепени към NI-NTA картон стъкло пързалки HisX6 използване на тагове. В допълнение към идентифициране на известни взаимодействия, 33 романа задължителен протеини са открити. Роман 150 липид-обвързващ протеини също са идентифицирани. Това проучване показа, че цялата proteome може да бъде в движение върху стъклена повърхност на екрана за пряко взаимодействие с протеини и малки молекули (26).
The coupling of mass-spectrometry and protein chips will have wide applications in identifying players in protein–protein interactions, and also in drug discovery (80). На прикачване на масата-спектрометрия и протеин чипове ще имат широко приложение в идентифицирането на участниците в протеин-протеин взаимодействия, а също и в откриването на наркотици (80). Proteins and small-molecule ligands bound to proteins immobilized on chip can be identified using matrix-assisted laser desorption/ionisation time of flight (MADLI-TOF) mass spectroscopy. Протеини и малките молекула лиганди длъжни да протеини в движение на чип може да бъде идентифициран чрез матрица с помощта лазерни десорбция / йонизация време на полет (MADLI-ТОФ) маса спектроскопия. Microwell formats are particularly suited for this purpose. Microwell формати са особено подходящи за тази цел. Thus, molecules and proteins that specifically bind to many different proteins can be identified and this information can be used to deduce molecular networks and pathways. Така, молекули и протеини, които специфично се свързват с много и различни протеини могат да бъдат идентифицирани и тази информация може да се използва за deduce молекулно мрежи и пътища.
One area that will require technological improvements is the analysis of membrane proteins. Една област, която ще изисква технологични подобрения е анализът на мембранни протеини. A large amount of proteins are likely to be membrane-bound, since as many as one third of all yeast proteins are membrane proteins or secreted proteins (81). А голямо количество протеини, които могат да бъдат мембрана-обвързани, тъй като повечето от тях, една трета от всички дрожди протеини са мембранни белтъци или секретират протеини (81). Due to the fact that many of these proteins are active when in membranes, it therefore may be necessary to purify or reconstitute them with associated lipids. Поради факта, че много от тези протеини са активни, когато в мембраните, следователно могат да бъдат необходими, за да чистя или възстановяват тях, свързани с липиди. However, this may not be so difficult. Все пак, това не може да бъде толкова трудно. One group was able to immobilize biotinylated membranes that contain the G-protein-coupled receptor rhodopsin on a gold-coated glass surface, and establish a functional assay for that protein (82). Една група е успял да immobilize biotinylated мембрани, които съдържат G-протеин-свързаните рецептори rhodopsin на злато картон стъклена повърхност, установяват и функционален тест за този протеин (82). Similar procedures may make it possible to analyze membrane proteins in a chip format. Подобни процедури могат да го направят възможно да се анализират мембранни белтъци в чип формат.
2) Diagnostics 2) Диагностика
Another area which will benefit from protein areas is diagnostics. Друга област, които ще се възползват от протеин райони е диагностика. Highly parallel analysis on arrays will allow determination of disease markers (eg tumour markers) in extracts with only a minimum of biopsy (sample) material, creating new possibilities for monitoring disease (cancer) treatment and therapy (83). Високо паралелен анализ на масиви ще позволи определянето на болестта маркери (напр. туморни маркери) в екстракти само с един минимум от биопсия (мостра) материал, създаване на нови възможности за контрол на болестта (рак) лечение и терапия (83).
.
Next: Protein Microarrays: Future Directions and Conclusions Следваща: протеин Microarrays: Бъдещето маршрути и заключения
References for Protein and Antibody Microarrays Препратки за протеин и Antibody Microarrays
Back to: Връщане:
Introduction and Background to Protein Chips and Antibody Chips. Въведение и на фона на протеини чипове и Antibody Чипове.
Types of Antibody and Protein Chips Видове на антитела и протеини Чипове
Disclaimer / Terms of Service | Privacy Policy | ©2005-2007 Molecular Station.com, All rights reserved. Отговорности / Условия за ползване | Поверителност | © 2005-2007 молекулярна Station.com, Всички права запазени.
Send this page to a friend Изпратете страницата на приятел
![[أربيك]](http://www.molecularstation.com/translate/images/flag_ar.gif){kind=small}
