Welcome to Molecular Station! Добре дошли в молекулярна станция!

You have to register before you can post on our forums or use our advanced features. Трябва да се регистрирате преди да можете да публикувате на нашите форуми, или да използвате допълнителни функции. Register Now! Регистрирайте се! Its Free and Fast! Тяхното свободно и бързо!

Already registered? Вече сте регистрирани? Login now below. Вход за сега по-долу.

User Name: Име:

Password: Парола:

Remember Me? Запомни ме?

Already registered and Forgot your password? Вече сте регистрирани и Забравили сте паролата си? Click below to recover it. Кликнете по-долу, за да го възстанови.

Recover Lost Password Забравена Забравена парола

Join now - it's fast and free! Присъединете се към момента - това е бързо и безплатно!

Molecular Station is THE largest network of researchers, scientists and science lovers anywhere! Молекулярна станция е най-голямата мрежа от изследователи, учени и любители на науката навсякъде!

Recent Forum Posts Нова Форум постове

Gene Expression Analysis - Bioinformatics Джийн анализ на словото - Биоинформатика

Gene expression can be determined by several methods including in broad terms protein expression, and mRNA expression. Джийн израз може да се определи чрез няколко метода, включително и по-широка гледна точка протеин словото, и словото mRNA.

mRNA Expression Analysis mRNA израз Анализ

mRNA expression analysis or expression of mRNA levels can be assayed by multiple techniques at a large-scale level these include: mRNA словото анализ или израз на mRNA нива могат да бъдат assayed от няколко техники за по-мащабна степен Те включват:

• cDNA microarray analysis cDNA microarray анализ
• EST or expressed cDNA sequence tags Et или cDNA последователност, изразена таговете
• SAGE (Serial Analysis of Gene Expression) Свинско месо (сериен Анализ на Джийн израз)
• Massively Parallel Signature Sequencing (MPSS) Успоредно с масивен подписа секвениране (MPSS)
• multiplexed in-situ hybridization multiplexed в разположени на хибридизация

At a smaller scale or to confirm results of a larger-scale one can use the following mRNA expression techniques: По-малък мащаб, или да потвърди резултатите на по-голям мащаб могат да се използват следните техники mRNA израз:

• RT-PCR
• Real-Time PCR PCR в реално време
• Ribonuclease protection assay (RPA) Рибонуклеаза защита тест (RPA)

However, bioinformatic analysis can be used. Въпреки това, bioinformatic анализ могат да бъдат използвани. Bioinformatic analysis allows the bypassing of biological measurement bias and noise of the specific techniques and uses statistical tools to separate significant change in gene expression from noise in large-scale or high-throughput gene expression studies. Bioinformatic анализ позволява неспазването на биологичното пристрастия и измерване на шума на специфични техники и инструменти за статистически използва отделно значителна промяна в гена изразяване от шума в голям мащаб или с висока производителност ген словото проучвания.

Such studies can be employed to determine the genes implicated in a disorder: one might compare microarray data from cancerous epithelial cells to data from non-cancerous cells to determine the transcripts that are up-regulated and down-regulated in a particular population of cancer cells. Тези проучвания могат да бъдат използвани за определяне на гени, замесени в нарушения на: можеше да се сравни microarray данни от cancerous епителните клетки с данни от не-cancerous клетки за определяне на транскрипция, които са най-регулиран и определяне на регулирани по-специално на населението на раковите клетки .

Affymetrix GeneChip Technology Analysis Affymetrix GeneChip технология за анализ

Affymetrix GeneChip Technology is used frequently to analyse mRNA expression patterns using a microarray approach. Affymetrix GeneChip технология се използва често да анализира mRNA модели на изразяване чрез microarray подход.

Raw data generated from GeneChip probe arrays can be analyzed using the Affymetrix (MAS)4.0 and MAS5.0 (Microarray Analysis Suite) software. Суровите данни, генерирани от GeneChip сонда масиви могат да бъдат анализирани, използвайки Affymetrix (MAS) 4,0 и MAS5.0 (Microarray Анализ Suite) софтуер.

Microarray Analysis Suite software is able to calculate a variety many measurements using the hybridization intensities measured by the scanner from the probe arrays. Microarray Анализ Suite софтуер е в състояние да изчисли много различни измервания, използвайки хибридизация интензивност се измерва със средства за скенер от сонда масиви.

Some Affymetrix analysis algorithms Някои Affymetrix анализ на алгоритми

Raw Data Analysis Суровите данни анализ

The intensity from the entire probe array is used for Background and Noise calculations in raw data analysis. Интензитетът от целия спектър на проби се използва за фон и шума изчисления на суров анализ на данните.

Other metrics compare the intensities of the sequence-specific Perfect Match (PM) probe cells with their control Mismatch (MM) probe cells for each probe set to determine if a transcript is Present (P), Marginal (M), or Absent (A). Други показатели за сравняване на интензитет на редица специфични за перфектното съвпадение (PM) сонда клетки с техните контролни разминаване (mm) сонда клетки за всяка сонда е да се определи дали един препис е налице (P), маргинални (М), или Отсъстващ (A ). Next, the numbers of Positive and Negative probe pairs are determined for every probe set. След това броят на Позитив и негатив сонда двойки се определят за всяка сонда в стаята. The numbers of Positive and Negative probe sets are then used to derive metrics that describe the performance of each probe set, the Positive Fraction and the Pos/Neg Ratio. Броят на Позитив и негатив сонда множества са използвани след това да получите показатели, които описват работата на всяка сонда в стаята, по позитивен фракция и Поз / Neg система. Raw data analysis also results in Absence and Presence Calls, Average difference, and Expression Levels. Суровите данни и анализ на резултатите при отсъствие и присъствие призовава, Средна разлика, и изразяване нива.

Comparison Analysis Сравнение Анализ

Comparison analysis gives Normalization and Scaling, Fold Change Calculation and Correlation Coefficients. Сравнение анализ дава НОРМАЛИЗИРАНЕ И УВЕЛИЧАВАНЕ, ромбове Промяна Изчисление на съответствията и коефициенти.

Functional Relationships Функционална запознанства

Functional Relationships can be assayed by using several methods including: Функционални връзки могат да бъдат assayed с помощта на няколко метода, включително:

• Listing genes by changes in their expression including fold-Increase or Decrease Регистрационните гени от промените в словото си, включително пъти по-увеличение или намаление
• Phylogenetic Trees Phylogenetic Дървета
• Self-Organizing Maps Самостоятелно организиране на карти
• Relevance Networks Значимост Мрежи

Protein Expression Analysis Протеин словото анализ

See protein expression analysis for more information on this topic. Разглеждане на протеин словото анализ за повече информация по тази тема.

Gene Expression Bioinformatics Forum Джийн словото биоинформатиката форум

Discuss and post questions about gene expression in the Bioinformatics Forum . Обсъдят и въпроси за пост ген изразяване в Биоинформатика форум.