| [3د-بسّم] - http://www.sbg.bio.ic.ac.uk/\~3dpssm/ بروتين ثني تمييز يستعمل [1د] و [3د] تسلسل قطاع جانبيّ يزوّج مع ثانويّة بنية وتذاوب إحتمال معلومة. - [يقرأ كثير [3د-بسّم]] |
| [بيوينفو3د] - http://bioinfo3d.cs.tau.ac.il/ [بيوينفو3د] تجميع الأدوات للتحليل إنشائيّة بروتينات ، بما في ذلك أدوات لإستقامة إنشائيّة وتنبّؤ من بروتين تفاعلات. - [يقرأ كثير [بيوينفو3د]] |
| [بسدّ] - http://iris.physics.iisc.ernet.in/bsdd/ [سرشس] [بسدّ] (جزيء حيويّ قطعة [ديسبلي دفيس]) ل ويعرض [أوسر-دفيند] تسلسل الحافز في يعرف بروتين بنى. هذا نسيج يدمج يؤسّس أداة ال [غرفيكس بكج] ال [رسمول] لتصور. - [يقرأ كثير [بسدّ]] |
| [كسبر] - http://igs-server.cnrs-mrs.fr/Caspr/index.cgi [كسبر] نسيج أداة ل يبني نماذج إنشائيّة لبروتين تسلسل يستعمل جزيئيّة إستبدال وتناظر يشكّل. يطبّق البرمجيّة يشغل مقاربة أنّ يستعمل [ت-كفّ] أن ينتج إستقامة ، [مودلّر] أن ينتج تناظر نماذج ، و- [يقرأ كثير [كسبر]] |
| [كث] - http://www.biochem.ucl.ac.uk/bsm/cath_new/index.html قاعدة معطيات من يشغل بروتين بنية تصنيف وفقا ل صنف [(ك)] ، الهندسة المعماريّة [()] ، طوبولوجيا [(ت)] و [سوبرفميلي] متشاكلة [(ه)]. - [يقرأ كثير [كث]] |
| [س-مك] - http://cemc.sdsc.edu يتعدّد بروتين بنية إستقامة يوصل نادلة أيّ يخلق [ألّ-تو-لّ] أزواجا إستقامة يستعمل توافقيّة إمتداد برنامج وبعد ذلك يستعمل [مونت-كرلو] تحسين طرق تحسين متكرّرة شاملة. نتيجات منسّق يستعمل [جو] - [يقرأ كثير [س-مك]] |
| [كلوسبرو] - http://nrc.bu.edu/cluster/ [كلوسبرو] أداة ل تلقائيّا يحسب الترصيف من اثنان بروتين بنى يزوّد بالمستعملة (أو ك [بدب] [إيدس]). النتيجة مجموعة يرتّب قائمة ميلان إلى جانب من مركبات [بوتتيف] ، يؤمر ب يعنقد خاصية. - [يقرأ كثير [كلوسبرو]] |
| [كلوردو-3د] - http://asia.genesilico.pl/colorado3d/ [كلوردو-3د] يسمح أنت أن يلوّن ك بروتين بنى أن يشير الوجود من أخطاء ممكنة في بروتين بنية (يكشف ب [أنولا] ، [بروسيي] ، برهنت أو [فريف3د]) ، يدفن بقية ، وتسلسل حفظ. يرجع النادلة [بدب-فورمتّد] مبرد - [يقرأ كثير [كلوردو-3د]] |
| إمتداد توافقيّة من الممر أفضل - http://cl.sdsc.edu/ce.html يحسب إستقامة إنشائيّة بين اثنان بروتين سلاسل ؛ أو بين [سنغل شين] والكاملة بروتين [دتا بنك]. - [يقرأ أكثر إمتداد توافقيّة من الممر أفضل] |
| توافق الآراء نادلة - http://structure.bu.edu/cgi-bin/consensus/consensus.cgi التوافق الآراء يحوذ نادلة تسلسل إلى طبعة إنشائيّة يستعمل توافق الآراء من 5 مختلفة إستقامة طرق. أنتجت إجراء الإعتمادية ل كلّ إستقامة موقعة [إين وردر تو] تنبّأت الصلاحية المناطق لنسبيّة يشكّل. - [يقرأ كثير توافق الآراء نادلة] |
| [كنسق] - http://conseq.bioinfo.tau.ac.il/ [كنسق] أداة ل يتنبّأ عمليّا و [ستروكتثرلّي] مهمّة [أمينو سد] بقية في بروتين تسلسل. أسّست التنبّؤات على الافتراضات أنّ بقية من أهمية وظيفيّة غالبا يحفظ و [سلفنت-كّسّيبل] ، وأنّ من - [يقرأ كثير [كنسق]] |
| [كنسورف] - http://consurf.tau.ac.il/ [كنسورف] يسمح نادلة واحدة أن يخطّط مستويات من [أمينو سد] حفظ أن يعرف بروتين بنى [إين وردر تو] درست مناطق من أهمية ممكنة وظيفيّة على السطح من البروتين. [بدب] تطلّبت مبرد كمدخل ، ويتعدّد تسلسل [ألينمن] - [يقرأ كثير [كنسورف]] |
| [إلنمو] - http://igs-server.cnrs-mrs.fr/elnemo/start.html [إلنمو] (المرنة شبكة نموذج) أداة ل يتنبّأ ال يمكن حركات ([إي]. [كنفورمأيشنل] تغيرات وأخرى تغيرات إنشائيّة) من جزيئة ضخمة. يسمح هذا أداة مستعملات أن يحسب ، تخيّلت ، وحللت [نورمل مود] [لوو-فرقونسي] من [بروت] - [يقرأ كثير [إلنمو]] |
| [فتكت] - http://fatcat.burnham.org/ [فتكت] يزوّد ال [منس] أن يقارن اثنان [بدب-فورمت] بروتين بنى ، أو أن يبحث لبنى مماثلة إلى يعطى [بدب] بنية. المستعملة يستطيع زوّدت [بدب] [إيد] أو [أوبلوأد] بنية مبرد. ال [فتكت] يستخدم [وب سرفر] المرنة بنية [ألينمنت] - [يقرأ كثير [فتكت]] |
| يقفل [فولدمينر] و2 - http://foldminer.stanford.edu/ [فولدمينر] يحوذ [أوسر-سوبّليد] أو يعيّن سؤال بنية إلى قاعدة معطيات من وحيدة مجال أهداف أن يكتشف جار إنشائيّة والحافز مميّزة. سؤال بنى يستطيع أيضا كنت حاذيت إلى [أن ور موش] بنى [أوسر-سبسفيد] يستعمل ال [لوك] - [يقرأ كثير [فولدمينر] وتعقّب هويس 2] |
| [إيموت] - http://caps.ncbs.res.in/imot/iMOTserver.html [إيموت] (يتفاعل [موتيف]) صمّمت نادلة أن يبحث ل [سبتيلّي] يتفاعل الحافز بين بروتينات يشارك بنى مماثلة [3-ديمنسونل]. - [يقرأ كثير [إيموت]] |
| سعادة - http://www-cryst.bioc.cam.ac.uk/\~joy/ برنامج ل يعرض [3د] معلومة إنشائيّة في يتعدّد تسلسل إستقامة. - [يقرأ كثير سعادة] |
| [مودلّر] - http://salilab.org/modeller/ تناظر أو نسبيّة [مودلينغ] من [3د] بروتين بنى. - [يقرأ كثير [مودلّر]] |
| جزيئيّة [مودلينغ] لمبتدئات - http://www.usm.maine.edu/\~rhodes/SPVTut/index.html ممتازة ميدانيّة [سويسّ-بدبفيور/ديب] منظرة [تثتوريل] ؛ [موست-دو] قبل يحاول أن يستعمل [سويسّ-بدبفيور]. - [يقرأ أكثر جزيئيّة [مودلينغ] لمبتدئات] |
| [بدب2بقر] نادلة - http://agave.wustl.edu/pdb2pqr/ يصنّف نادلة أنّ يسمح مستعملات أن يحوّل [بدب] مبارد داخل [بقر] ب يضيف ذرة مفقودة ، يجعل هيدروجين يربط ويعيّن ذرّيّة حشوة وشعاع معلمات. ال ينتج [بقر] مبرد يستطيع كنت استعملت لحسابات خاصّ بالكهرباء السّاكنة أيّ يستطيع أعطيت تبصر - [يقرأ كثير [بدب2بقر] نادلة] |
| [بدبستسكن] - http://wwwmgs.bionet.nsc.ru/mgs/systems/fastprot/pdbsitescan.html [بدبستسكن] يأخذ [بدب] مبرد كمدخل ، و [سرشس] لنظائر [ستثكتثرل] مع [بدبست] مجموعة من يعرف موقعات وظيفيّة. - [يقرأ كثير [بدبستسكن]] |
| [بببويلد] - http://www.imtech.res.in/bvs/pepbuild/ [بببويلد] أداة أنّ يسهّل البناء ، من يعرف تسلسل وثانويّة/بنى ثلثيّة ، من يغطّي أو يكشف بروتينات. الإنتاج يولد في [بدب] شكل. - [يقرأ كثير [بببويلد]] |
| [بوف-ري] - http://www.povray.org/ مثابرة الرؤية [رترسر] ؛ إستعمال [إين كنجونكأيشن ويث] [سويسّ-بدبفيور] أن يخلق رسم بيانيّ لعرض ونشر. - [يقرأ كثير [بوف-ري]] |
| [بروتيندبس] - http://proteindbs.rnet.missouri.edu/ [بروتيندبس] يأخذ [بدب] [إيد] أو بنية كمدخل ، و [سرشس] لبروتين مماثلة بنى ثلثيّة يستعمل حاسوب تصور تقنيات. التراكب من بنى وال يحاذى عنصر من التسلسل يستطيع بعد ذلك كنت شاهدت على النسيج. - [يقرأ كثير [بروتيندبس]] |
| [بروتمينر-سّم] - http://proteminer.csie.ntu.edu.tw/ [بروتمينر-سّم] [سرشس] ال [بدب] لبروتينات مع أسس مماثلة ثلثيّة إلى واحدة يعيّن بالمستعملة. [فيلتر بروسسّ] استعملت أن بشكل ملحوظ عجّلت التحليل. - [يقرأ كثير [بروتمينر-سّم]] |
| [بفسر] - http://pvsoar.bioengr.uic.edu/ [بفسر] يأخذ [بدب] [إيد] أو بنية مبرد كمدخل ، و [سرشس] لأخرى بروتينات مع مناطق سطحيّة أنّ يكون مماثلة إلى السؤال بنية. - [يقرأ كثير [بفسر]] |
| [روبتّا] - http://robetta.bakerlab.org/ [روبتّا] يزوّد نادلة بروتين بنية تنبّؤ أدوات وقارن [ألنين] [سكنّينغ]. البنية أنجزت تنبّؤ ب إمّا مقارنة يشكّل أو [د] [نوفو] [روستّا] جزء إدخال طريقة. قارن [ألنين] [سكنّينغ] [إمبلو] - [يقرأ كثير [روبتّا]] |
| [س-سرش] - http://bioserv.rpbs.jussieu.fr/cgi-bin/SA-Search [س-سرش] أداة أيّ أولى يحوّل [بدب] بنية مبرد داخل تمثيل [أن-ديمنسونل] يستعمل أبجدية إنشائيّة ، وبعد ذلك [سرشس] لتشابهات يستعمل طرق معياريّة لتسلسل إستقامة. [س-سرش] - [يقرأ أكثر] |
| [سكيت] - http://bioserv.rpbs.jussieu.fr/cgi-bin/SCit [سكيت] مجموعة الأدوات يسهّل التحليل ويحرّر من بروتين [سد شين] تكيفات. يستعمل [بدب] مبرد كمدخل ، يسمح الأدوات المستعملة أن ينجز هذا مهام بما أنّ جدولة [أند/ور] يعدّد القيم من الزوايا ثنائيّ سطح ، يعدّد [ستروكتثرلّ] - [يقرأ كثير [سكيت]] |
| [سكب] - http://scop.mrc-lmb.cam.ac.uk/scop/ تصنيف إنشائيّة بروتينات - قاعدة معطيات يخلق بإدماج من تفتيش يدويّة ويشغل طرق. - [يقرأ كثير [سكب]] |
أرسلت هذا صفحة إلى صديقة